Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms