Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms