Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TcimQ9D915 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TcimQ9D915 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TcimQ9D915 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TcimQ9D915 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms