Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8H7

Oma1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oma1Q9D8H7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oma1Q9D8H7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Oma1Q9D8H7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms