Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl40Q9D783 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms