Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms2Q9D4B1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgms2Q9D4B1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgms2Q9D4B1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sgms2Q9D4B1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sgms2Q9D4B1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sgms2Q9D4B1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgms2Q9D4B1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgms2Q9D4B1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sgms2Q9D4B1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sgms2Q9D4B1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sgms2Q9D4B1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sgms2Q9D4B1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sgms2Q9D4B1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sgms2Q9D4B1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sgms2Q9D4B1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Sgms2Q9D4B1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sgms2Q9D4B1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sgms2Q9D4B1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Sgms2Q9D4B1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sgms2Q9D4B1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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