Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim42Q9D2H5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms