Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms