Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms