Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lhfpl3Q9CTN8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms