Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms