Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms