Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Nsmce3Q9CPR8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce3Q9CPR8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms