Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn6Q99PL6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn6Q99PL6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms