Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms