Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms