Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx4Q91YJ2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms