Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms