Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms