Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TgdsQ8VDR7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TgdsQ8VDR7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms