Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgtbQ8VD33 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms