Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

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Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gtf3c1Q8K284 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gtf3c1Q8K284 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gtf3c1Q8K284 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gtf3c1Q8K284 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gtf3c1Q8K284 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gtf3c1Q8K284 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gtf3c1Q8K284 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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