Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nhlrc3Q8CCH2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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