Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CntrobQ8CB62 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntrobQ8CB62 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms