Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcl3Q8BVF2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms