Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms