Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pggt1bQ8BUY9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms