Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gja6Q6S5G4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms