Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl2Q6PA06 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms