Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx6Q6P8X1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx6Q6P8X1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms