Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4Q6P1D7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms