Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL8

Scube1, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube1Q6NZL8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scube1Q6NZL8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scube1Q6NZL8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms