Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

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Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cntn4Q69Z26 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn4Q69Z26 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn4Q69Z26 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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