Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cd47Q61735 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cd47Q61735 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cd47Q61735 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cd47Q61735 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd47Q61735 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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