Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms