Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr1h2Q60644 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1h2Q60644 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1h2Q60644 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1h2Q60644 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1h2Q60644 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1h2Q60644 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms