Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtp3Q5QGU6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rtp3Q5QGU6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtp3Q5QGU6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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