Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms