Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pydc3Q3V3Q4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pydc3Q3V3Q4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms