Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc160Q3UYG1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc160Q3UYG1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms