Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms