Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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