Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms