Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnma1Q08460 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcnma1Q08460 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms