Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf4Q06507 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms