Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
TNP2Q05952 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms