Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fmn1Q05860 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fmn1Q05860 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fmn1Q05860 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fmn1Q05860 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fmn1Q05860 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fmn1Q05860 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fmn1Q05860 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms