Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms