Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox13Q04891 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox13Q04891 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms