Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms